尿素分解菌主要包括以下幾類：
芽孢桿菌（Bacillus species）
小球菌（Micrococcus species）
假單胞菌（Pseudomonas species）
克氏桿菌（Klebsiella species）
棒狀桿菌（Corynebacterium species）
梭狀芽孢桿菌（Clostridium species）
尿細菌（Ureaplasma species）
全部真菌和放線菌（包括但不限於Aspergillus, Penicillium, Rhizopus, Streptomyces等）
乳酸桿菌（Lactobacillus species）
這些微生物能夠分解尿素，其中一些常見的種類包括：
枯草芽孢桿菌（Bacillus subtilis）
地衣芽胞桿菌（Bacillus licheniformis）
黑麴黴（Aspergillus niger）
綠色木黴（Trichoderma viride）
釀酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）
這些微生物能夠有效地分解尿素，因此在農業、工業和環境保護等領域有着廣泛的應用。