在北方，巨菌草的越冬管理主要包括以下幾個方面：
控溫管理：巨菌草的生長溫度要求不低於12℃，因此冬季低溫時可以將其移到室內或大棚內越冬，不可露天栽種。
整地施肥：越冬前，深翻一次土壤，並施足基肥，以提高巨菌草的抗寒能力。一般每畝施有機肥500-1000公斤，或磷肥10-15公斤。
秸稈覆蓋：使用稻草、麥秸、玉米秸等有機物進行覆蓋，厚度以10-50厘米為宜，以起到保暖和吸收水分的作用。
地膜覆蓋：利用聚乙烯薄膜覆蓋防寒，薄膜袋套住植株，周邊覆土密封。
熏煙保溫：在霜凍來臨前點燃柴草、牛糞等產生煙霧的物質，以阻擋地面熱量散失並產生一定熱量。
大棚保溫：將巨菌草連根移栽到塑膠大棚內，根莖間隙用泥土覆蓋，並澆足水。
重點保護部位：越冬期間，特別保護巨菌草的根部和莖部，可以覆蓋保護材料增加保溫效果。
防寒措施：加強通風換氧，使用加熱器等設備控制水溫，注意使用安全。
注意事項：定期檢查水質，保持水體清潔，並清理雜物。對巨菌草進行剪枝，增加水中氧氣含量。
種株挖坑冬藏技術：選擇健康巨菌草植株作種株，確定收割時間，進行適當處理後存放於挖好的坑穴中，覆蓋細濕土和細沙土保溫，並插入塑膠透氣管保持適宜溫度。
通過上述措施，可以有效幫助巨菌草在北方安全越冬。