《影子武士》的操作方法如下：
移動。使用WASD鍵控制角色移動，←鍵左旋轉，→鍵右旋轉，↑鍵抬頭，↓鍵低頭，Ctrl鍵蹲伏，在蹲伏時按住Ctrl可以加快下落速度。
攻擊和防禦。滑鼠左鍵進行基礎攻擊，滑鼠右鍵進行瞄準或次要攻擊，R鍵填裝彈藥（在近戰武器使用時則是迴避），1至8鍵選擇不同的武器，E鍵使用/拿取物品，M鍵切換地圖，I鍵打開物品欄，F9鍵開啟拍照模式。
特殊攻擊。施展突刺攻擊，按住W鍵+滑鼠右鍵；發動迴旋砍，按住A鍵+滑鼠右鍵或D鍵+滑鼠右鍵；蓄力攻擊，按住滑鼠右鍵可以蓄積能量，釋放時能增強攻擊力。
此外，遊戲中的某些敵人（如拿著紅色武器的敵人）會向後閃躲，需要連續向前攻擊兩次才能擊敗它們。遇到更強力的Boss時，它們會結合綠色武器敵人的特點（如後閃躲）和紅色武器敵人的特點（如向前翻滾閃躲），因此戰鬥時需要準確把握攻擊時機。