微生物學考研的科目通常包括以下四門：
政治。這是全國統考的科目，代碼為101。
英語。通常分為英語一（學碩考）和英語二（專碩考），代碼分別為201和204。部分院校也會要求較高的專碩考生考英語一。
專業課一。通常是專業基礎課，偏理論基礎，由各學校自主命題。
專業課二。通常是專業實務課，偏專業研究，也是由各學校自主命題。
具體的考試科目可能會因不同學校和專業而有所不同，考生需要參考目標學校和專業公布的招生專業目錄來確定具體的考試科目。例如，中國科學院大學的微生物學考研科目包括思想政治理論、英語一、生物化學與分子生物學、微生物學；吉林大學的微生物學考研科目包括思想政治理論、英語一、基礎微生物學、基礎細胞生物學；河北科技師範學院的微生物學考研科目包括思想政治理論、英語一、普通生物學、生物化學（自命題）。