房產證與不動產權證主要在以下幾個方面有所區別：
名稱和全稱。房產證的全稱是中華人民共和國房地產權證，而不動產權證的全稱是中華人民共和國不動產權證。
內容。房產證包含房屋所有權人、共有情況、房屋坐落、登記時間、房屋性質、規劃用途、房屋狀況和土地狀況等信息，不動產權證相比房產證增加了鐳射區、不動產單元號、使用期限等內容，每本不動產權證都有一串由28位數字組成的不動產單元號，作爲房產的唯一標識。
發證機關。房產證的印章是市（縣）房地產管理局或市人民政府的印章，而不動產權證的印章是由縣級以上人民政府依法確定的統一負責不動產登記工作的部門。
費用。辦理房產證時，需要根據土地面積和房產面積進行兩次測繪，繳納兩次測繪費用以及兩次制證成本費，而辦理不動產權證時，測繪和制證成本費只需收取一次。
版本。不動產權證有兩種版本，單一版和集成版，單一版證書記載一箇不動產單元上的不動產權利，集成版證書記載同一權利人在同一登記轄區內享有的多箇不動產單元上的不動產權利；房產證只有一種版本。
適用範圍。房產證是房屋所有權的憑證，主要用於已建成的存量房買賣交易，而不動產權證能夠登記的權利包括集體土地所有權、建築物構築物所有權、建設用地使用權等，適用範圍更廣。
監製單位。房產證的監製單位爲住房和城鄉建設部，而不動產權證的監製單位是國土資源部。
二維碼。不動產權證上增添了二維碼，用於存儲不動產登記信息，方便查詢和驗證。
這些區別反映了中國不動產登記制度的演變和完善過程。