扦插的原理主要基於植物的再生能力和生根機制。
扦插時，植物體某部分被切除後，其剩餘部分能夠通過再生機制彌補損傷，恢復協調。在扦插過程中，切口處會首先形成癒合組織，隨後在該組織上形成生長點，從而促進新根和新芽的形成。根據生根類型的不同，扦插可以分為癒合組織生根類型、皮部生根類型等。癒合組織生根類型主要依賴於插條基部形成的愈傷組織來生根；而皮部生根類型則主要依靠插條的皮部生根。
此外，扦插的成功還依賴於適宜的環境條件，如溫度、濕度和光照。在扦插過程中，植物的生長素、生長抑製劑和其他生理基礎也發揮著關鍵作用。