漢語拼音的聲調分為四種，分別是陰平（一聲）、陽平（二聲）、上聲（三聲）和去聲（四聲）。這四種聲調在漢語中是固定不變的，它們通過聲音的高低和升降來區別意義。此外，還有一種特殊的聲調，稱為輕聲，有時也被稱作第五聲，但在漢語拼音中通常不標調。
陰平（第一聲）：念起來聲音平穩，用五度標記法表示為55，即從音高5開始，保持到音高5結束。
陽平（第二聲）：聲音從低音升到高音，用五度標記法表示為35，即從音高3開始，升到音高5結束。
上聲（第三聲）：聲音先降後升，用五度標記法表示為214，即從音高2開始，降到音高1，再升到音高4結束。
去聲（第四聲）：聲音從高音降到低音，用五度標記法表示為51，即從音高5開始，降到音高1結束。
輕聲通常用於名詞後綴、語氣詞、動詞趨向等，如「爸爸」、「媽媽」、「來」、「去」等詞中的第二個字。輕聲的發音特點是第一個字拉長音，後邊的字短音。
在給漢語拼音標聲調時，需要注意規範，避免隨意標註導致聲調模糊不清。例如，一聲要標得平直，二聲要標得升揚，三聲要注意先降後升的變化，四聲要標得降落。此外，當拼音由複韻母組成或三拼音節組成時，即一個音節中出現兩個單韻母時，標調規則有所不同。例如，「aoe,iuü是一家」，當「a」不在時，找「o」，再不在時找「e」，如果「i」和「u」並排出現，則標在後面的元音上。
在拼音中，當jqx與ü、ün、üe相拼時，ü上的兩點要去掉，這是因為小魚（ü）見了jqx後，去掉兩點還是ü。