《數碼寶貝故事：失落的進化》是一個系列冒險遊戲，玩家將通過七大區域進入不同的數碼世界，與新認識的朋友們互相戰鬥、合作，來揭開更大的秘密。
在遊戲中，玩家扮演被選中的孩子，他們將進入第八區，一個神秘島嶼。在這裡，他們將與人類和數碼獸建立友誼，並聯手對抗邪惡的破壞者。
《數碼寶貝故事：失落的進化》在數碼寶貝原有設定上，新增了情感和記憶的數碼變異系統，變異可成長並提升等級，還有新增的羈絆系統，把所有數碼獸的屬性整合在一起。而戰鬥採用角色扮演回合制戰鬥方式，在冒險探索中通過打敗與NPC組隊或對話、解鎖故事。