日本王室的姓氏主要包括以下幾個：
源氏：源氏是由嵯峨天皇賜姓給皇子女們開始的，因此最初被稱為嵯峨源氏。源氏分為多個分支，其中清和源氏是最顯赫的一支。
平氏：平氏因桓武天皇建都於平安京而賜姓給桓武、仁明、文德、光孝天皇的皇子女們。桓武那支平氏是最著名的。
藤原氏：藤原氏是在日本大化革新時期，天智天皇為了緬懷中臣鐮足而賜予的姓氏。中臣鐮足的後人以及與其聯姻的家庭均以藤原為姓。
橘氏：橘姓是在天明天皇的繼位式典上賜給藤原不比等的妻子，是第一個被賜給女性的姓。橘姓女性與皇家及權臣聯姻，使得橘姓也成為名門望族。
豐臣氏：豐臣姓是在安土桃山時代授予掌握政權的關白羽柴秀吉的姓氏。朝廷在1586年時賜給秀吉豐臣朝臣的氏姓。
除了上述姓氏，日本貴族姓氏還包括清原氏、菅原氏、大江氏、安倍氏、賀茂氏、紀氏、小野氏、棲川、大後、閒院、武內、蘇我、物部等。