日本的行政劃分系統主要分為兩個層級，具體如下：
一級行政區。共有47個，包括1個都（東京都）、1個道（北海道）、2個府（京都府、大阪府）和43個縣。這些一級行政區是平等的，各自擁有自治權，政府機構稱為「廳」，包括都廳、道廳、府廳、縣廳。
二級行政區。包括市、町、村，以及特別區。特別區主要指東京都下的23個特別區，這些特別區在行政上與市、町、村同為二級行政區。此外，北海道還設有14個振興局以提高行政效率。
另外，日本還設有「郡」這一行政單位，雖然其地位已開始虛化，但仍具有地址表記、廣域行政圈範圍、都道府縣議會選舉劃分等功能。日本的市制度可分為政令指定都市（人口約50~70萬）、中核市（人口達30萬人）、特例市（人口達20萬人）以及一般的市（人口達5萬人的町、村）等四個等級。