日本著名的出版社包括：
集英社(Shueisha)。該社全稱為「株式會社集英社」，成立於1926年，是日本最大的綜合出版社之一，以出版漫畫、文藝書和小說而聞名。它是最著名的動漫出版社之一，發行了眾多知名漫畫雜誌，如《周刊少年Jump》，其中包括《海賊王》《鬼滅之刃》《銀魂》等著名漫畫作品。
講談社(Kodansha)。該社全稱為「株式會社講談社」，成立於1909年，是日本最大的綜合性出版社及著作權持有者。講談社是日本主要的漫畫出版社之一，與集英社、國小館並稱日本出版界的漫畫三雄。它以出版趣味性和教育性的書籍而著稱。
國小館。該社全稱為「株式會社國小館」，與集英社、白泉社等一起成立了一橋出版集團，是日本最大的出版集團之一。
岩波書店。該書店是日本最重要的左翼文化人的出版陣地，被視為日本「知識人」「教養派」的代表。
角川書店。該書店是日本出版社的後起之秀，以迎合青年讀者和投資電影產業而著稱。
文藝春秋。該出版社被認為是偏保守派、右翼。
此外，日本還有著名的繪本出版社如福音館書店、白楊社、童心社等，專注於兒童圖書和繪本的出版。