《名偵探柯南》的結局猜想如下：
柯南與黑衣組織鬥爭並成功擊敗他們。柯南服用了能夠恢復原貌的解藥，與小蘭結婚，並有了孩子，以此紀念這部作品。
柯南雖然擊敗了黑衣組織，但在過程中犧牲。例如，灰原哀可能在保護柯南的過程中犧牲，或者柯南在戰鬥中失去記憶，選擇繼續以小學生的身份生活，不再恢復原貌。
柯南和黑衣組織同歸於盡。在這種極端情況下，小蘭得知真相後選擇離開，前往倫敦，並在那裡遇到並嫁給了一個與工藤新一相似的人。
此外，還有一種觀點認為《名偵探柯南》可能會一直連載下去，沒有明確的結局，因為作者青山剛昌捨不得讓故事結束。在這種構想中，柯南、小蘭等主要角色將永遠年輕，繼續陪伴觀眾。