普查方法主要包括以下幾個步驟：
清查方法。採用「地毯式」清查，對轄區內的所有法人單位、產業活動單位和從事第二產業及第三產業的個體經營戶進行全面清查，具體按照《普查單位清查辦法》執行。
普查登記方法。在全面清查的基礎上，對法人單位和產業活動單位進行全面調查；對個體經營戶，則進行抽樣調查，具體方案為《個體經營戶抽樣調查方案》。對於投入產出調查單位，採用重點調查和典型調查相結合的方式。
數據報送方式。在單位清查階段，普查員使用電子設備如PAD或手機採集數據；在普查登記階段，可以通過普查員入戶採集、普查對象自主填報、部門組織普查等方式獲取數據。
普查的業務流程還包括制定普查方案、普查區劃分及繪圖、選聘及培訓普查人員、編制清查底冊、普查登記、數據檢查審核與驗收等多個環節。