使用月亮杯的方法包括以下幾個步驟：
摺疊月亮杯。常用的摺疊方法有C形摺疊或鬱金香式摺疊，摺疊後，月亮杯應呈C形或類似鬱金香形狀。
置入月亮杯。身體保持放鬆，採用半蹲姿勢或自己感覺舒適的姿勢，使用一隻手撥開陰唇，另一隻手將月亮杯慢慢推入陰道，置入時，可輕輕旋轉以幫助推進，如果使用的是帶有尖角的設計，可以先將尖角推入，再慢慢推進整個杯子。
檢查和調整位置。置入一定深度後，鬆開手，檢查月亮杯是否完全展開，可以通過觸摸杯子外圍或感受是否有吸附感來判斷，如果聽到「嘣」的一聲，通常表示杯子已完全彈開。
排液和更換。月亮杯具有排液功能，可以通過捏壓杯子兩側的小孔來排出液體，根據流量調整更換頻率，量多時建議每3至4小時更換一次。
取出月亮杯。清潔雙手並剪短指甲，使用兩根手指伸入陰道內，找到杯底的小尾巴，捏住杯底，破壞真空環境後輕輕拉出。
此外，使用月亮杯時還應注意清潔和消毒，使用前後需用沸水消毒，保持衛生。