有機化學哲理主要包括以下幾個方面：
1. 自然法則的至高主導：有機化學是基於分子的科學，所有的自然物及人造物都是以有機化學原理構建而成，它是探索生命起源和物質運行的哲理學門。
2. 事物之間的相對關係：有機化學哲理認為，任何物質的組成都是與其他的物質相互作為而存在，相互影響、相互依存。因此，事物的相對關係是有機化學的重要哲理。
3. 生命的偉大奧秘：生命的起源和發展，在無數的演變過程中形成了多樣性的生物圈，在有機化學哲理中，生物圈與環境的平衡、互動和共生是其重要的觀念。
此外，還包括個體差異和諧統一、可持續發展、質變觀念等。總之，有機化學哲理主張事物之間存在著各種各樣的相對關係，要按照生命的規律去規劃和發展生命，同時還需要保持生態環境的平衡。