末端分析法主要用於分析蛋白質肽鏈兩端的胺基酸。具體可以分為N端分析和C端分析兩部分。
N端分析：
方法：
桑格-庫森法（Sanger法）：一種常用的測序方法，適用於DNA和RNA的序列測定。
丹磺醯氯法（DNS法）：適用於蛋白質或多肽N末端的測定。
埃德曼降解法：可以連續測定胺基酸，並且可以自動化操作，是目前N末端序列分析中套用最廣的方法之一。
二硝基氟苯法（FDNB法）：也是一種用於蛋白質或多肽N末端測定的方法。
基於質譜的方法：利用質譜技術對蛋白質N末端進行精確分析，廣泛套用於蛋白質組學和生物標記物的發現。
套用：蛋白質N末端測序不僅用於確定胺基酸的種類和排列順序，還用於確認重組蛋白的表達情況，如是否完整表達、表達過程中是否發生斷裂以及N端序列是否發生修飾等。
C端分析：
方法：主要使用外肽酶，如羧肽酶，將肽鏈的羧基末端胺基酸切下進行分析。
綜上所述，末端分析法是蛋白質研究中的重要技術，隨著生命科學和測序技術的發展，這些方法也在不斷更新和進步。特別是埃德曼降解法和基於質譜的方法，在N末端序列分析中展現出廣泛的套用和優越性。