枕上書故事的主要內容是：
故事的主人公是東華帝君和青丘國女鳳九的曠世情緣。在這個故事裡，小燕樂公主鳳九，曾夜夜纏著養父去學法術。 在十八萬歲那年遇到了一個苦苦暗戀她十五萬歲的夫子東華。 可命運讓兩人在剛萌芽就面臨著巨大的苦難。經歷層層劫難終於可以放下心中執念準備將天命付對方時，鳳九卻是注定要和他相忘於東海之濱的三生石上，終成陌路。
之後，鳳九被生生困在了雷池之底，為了破劫的鳳九全然忘記了東華帝君，可他卻依然執著守候，終於兩人經歷了種種，最後走到了一起。
這個故事裡還有很多細節和角色，比如女主角青丘國女、古靈精怪的四海八荒第一美女鳳九及率真可愛的小燕樂公主，父輩桃林的神官們，與鬼界孤王子相識卻默默付出很多愛意的常沁等，每個人物和故事都有其獨特的性格和魅力。