染色液配方多樣，具體取決於所需的染色目的和類型。以下是一些常見的染色液配方：
細菌染色。齊氏(Ziehl)石炭酸品紅染液：將5克石炭酸溶解在95毫升蒸餾水中，再將0.3克鹼性品紅溶於10毫升95%酒精中，混合兩種溶液後搖勻、過濾。羅氏(Loeffler's)美藍染液：將5克美藍溶於100毫升95%酒精中，製成美藍-酒精飽和液。革蘭氏(Gram's)染液：包括結晶紫染液、碘液、95%酒精溶液和番紅花紅液。
細菌特殊染色。芽孢染液：用5克孔雀綠溶解於100毫升蒸餾水中製成甲液，0.5克番紅花紅溶解於100毫升蒸餾水中製成乙液。莢膜染液：用0.1克結晶紫溶解於100毫升蒸餾水中製成甲液，20%硫酸銅脫色劑製成乙液。鞭毛染液：用2毫升飽和明礬溶液和5毫升5%石炭酸溶液混合製成甲液，11克鹼性品紅和100毫升95%酒精混合製成乙液。
植物細胞壁染色。纖維素細胞壁染液(Ⅰ)：將0.1克固綠溶於100毫升95%酒精中。纖維素細胞壁染液(Ⅱ)：將20克氯化鋅、6.5克碘化鉀溶於100毫升蒸餾水中。
其他染色劑。埃利希(Ehrlich)氏蘇木精染液：將2克蘇木精溶於100毫升乙醇中，加入10毫升冰醋酸、100毫升蒸餾水和100毫升甘油，直至液體顏色變為深紅色。吉姆薩(Giemsa)氏母液：將1克吉姆薩粉末先溶於少量甘油，再加入66毫升甲醇。