在《名偵探柯南》中，有一些案件被認為是相當恐怖的。以下是一些觀眾普遍認為恐怖的案件：
美術館殺人事件。這個案件中，美術館老闆喬裝成盔甲騎士，用利劍將人釘死在牆上。
步美綁架案。步美在黑暗中摸索時，摸到了鋸子和大紙團里包裹的一顆人頭。
幽靈鬼屋的真相。在這一集中，柯南和他的朋友們探索一棟鬧鬼的房子，經歷了流血的馬桶、窗外的鬼影和電視上的詭異女人。
霧天狗殺人事件。這個案件講述了一個老和尚用天狗傳說逼人留宿，結果被吊死在十米高空。
詛咒假面的冷笑。在這一集中，柯南受邀參加一個晚會，其中有一個愛好收藏面具的人成為了兇手。
月光殺人事件。在這個案件中，每當響起鋼琴協奏曲時，就會出現一位受害者。
山莊繃帶怪人殺人事件。兇手全身包裹著繃帶，殘忍地殺人分屍，並將死者的頭藏在懷裡帶出去偽造現場。
圖書館殺人事件。在圖書館裡，柯南等人發現了一具屍體，館長的眼睛是紅色的，表情十分痛苦驚嚇。
藍色古堡探索事件。在這一集中，古堡中藏著秘密，有人不斷消失，並且發生了大火事件。
福爾摩斯迷殺人事件。在這個案件中，有人被殺死後放入汽車，車子卻無人駕駛自己發動了。
這些案件不僅因為其血腥和恐怖的場景而聞名，還因為其創意和驚悚的故事情節讓觀眾難以忘懷。