根目錄是指計算機文件系統中的最頂層目錄，是相對子目錄而言的。
在計算機中，所有其他文件和目錄都位於根目錄之下。在Unix和Linux系統中，根目錄通常表示爲一箇斜槓(/)；而在Windows系統中，根目錄通常表示爲C:\。根目錄是文件系統的起點，它包含了操作系統的主要文件和程序，如Windows系統中的C:\Windows\System32。
此外，根目錄在文件系統建立時即已被創建，其主要目的是存儲子目錄（也稱爲文件夾）或文件的目錄項。在網站託管或雲服務中，根目錄也指存放網站程序或文件的第一層文件夾。