殷姓的起源主要有以下幾個來源：
出自子姓。帝嚳之子契（殷契）被封於商，其裔孫成湯建立了商朝。商朝第十代君王盤庚將國都從奄（今山東曲阜）遷至殷（今河南安陽），因此商朝也被稱為「殷商」。周武王滅商後，封商紂王的庶兄微子啟於宋，其他殷商後裔沒有得到封號的，以國名為姓，稱殷姓。
出自地名。河南禹州的殷水，居住者以地名為姓。
少數民族改姓。包括清代滿洲八旗姓音佳氏改姓殷，以及現今的彝族、回族等民族中有此姓。
此外，還有一些其他的來源，例如部分居住在山東的殷姓因方言影響改姓衣，以及宋朝時期一部分殷姓因避諱改姓湯。這些不同的來源共同構成了殷姓的複雜性和多樣性。