氰基丙烯酸酯是一類具有高毒性的化學物質，它們對人體的多個系統都可能造成危害。
氰基丙烯酸酯膠水接觸皮膚後可能引起皮炎、過敏甚至嚴重的化學灼傷。吸入這些膠水的氣體可能會導致呼吸急促、氣喘、頭暈等症狀，長期吸入可能損害肺部。而且，這些物質接觸眼睛可能造成刺痛、紅腫等損傷。長期接觸氰基丙烯酸酯膠水可能對人體造成毒性作用，影響血液、內分泌等多個系統。
然而，有研究顯示，某些氰基丙烯酸酯如α-氰基丙烯酸酯的急性毒性試驗結果表明其屬於實際無毒級，且沒有致癌致畸性。但考慮到其潛在的健康風險，使用時仍需注意通風並避免與皮膚、眼睛接觸。如果不慎接觸，應立即用大量清水沖洗並尋求醫療幫助。