水性磁漆的施工方法主要包括以下幾個步驟：
表面準備。首先，需要確保待塗刷的物體表面平整、無油污、無塵、無雜質，以保證磁漆的附著性和美觀性。如果表面有破損、裂縫等，應先用補牆膏修補並打磨平整。
底漆處理。進行底漆塗刷，保證底漆均勻塗抹，塗刷間隔為2~3小時，實際時間根據氣溫和濕度可適度延長。底漆塗刷乾燥後，用砂紙打磨，再塗刷第二遍底漆。
磁漆塗布。將磁漆充分攪拌均勻後，用塗料刷均勻塗刷在待塗物品表面上。第一遍磁漆塗刷後，可根據需要塗刷第二遍。每次塗刷後，塗刷間隔時間至少為2小時，可根據氣溫和濕度適度延長。
乾燥和定型。塗刷完成後，保持物品表面乾燥，可以使用風扇、空調等，協助乾燥。磁漆乾燥期一般為24小時，但實際塗刷時間和乾燥時間也會因物品大小和氣溫、濕度等因素而變化。
注意事項。施工時保持良好的通風，環境溫度低於5攝氏度或者濕度大於70%的狀況下不建議施工。嚴禁與其它塗料及有機溶劑混合。施工結束，所用器具應立即用清水沖洗，以防乾固。剩餘漆應密閉保存，若有乾皮影響使用，可在使用前用100目絲網過濾。
此外，施工環境應選擇晴天，環境溫度在5~40℃，相對環境濕度在80%以下為佳。塗裝後的漆膜4小時內不可雨淋，更不可用水沖洗。