自然流速是指水體在自然條件下流動的速度。水體的自然流速受到多種因素的影響，包括地形地勢、河流寬度、水流含沙量、河床河岸的糙率係數、河中間是否有障礙物、是否有支流匯入等。例如，地形比較平坦的河道，落差小，水流速度較慢。較寬的U形河道，水量分散，動力減弱，流速也會變小。水流從上中游攜帶泥沙到下游開始沉積，使河床升高，下游與上中游的落差減小，導致流速減小。
測量水體自然流速的方法有多種，包括：
計時法：用桶盛水，用秒表計時。如果在t秒鐘得到M公斤水，水龍頭內徑d米，就可求出流速V(米/秒)。流速的計算公式是:V=4M/1000t3.14dd。
電導率感測器法：在水流的被測區段沿水流方向埋設兩個電導率感測器，利用電解質溶液推送裝置向水流脈衝式推送電解質溶液，比較兩個電導率感測器測得的兩個位置的電導率脈衝，計算兩個脈衝之間的時間間隔，用兩個電導率感測器之間的距離以及電導率脈衝的間隔時間，求得水流流速。
浮標法：選擇一段河道比較正直的地方來進行，先把上下游兩個斷面測出並量出二個斷面之間的距離，把浮標放在距離上游斷面約10米的河面，等浮標經過上游斷面時，立即計算時間，看浮標由上游斷面流至下游斷面共需要多長時間。將距離除以時間即可得出流速。
以上方法可以根據具體的測量需求和環境條件選擇使用。