清洗水袋的方法如下：
手洗。將水袋裝入接近滿的溫水（注意不能用熱水），然後加入洗潔精。也可以添加天然清潔劑，如檸檬汁、小蘇打或白醋。稍加搖勻後等待20分鐘，以便更好地清潔。如果有小刷子等工具，可以用它來清洗水袋內部。同時，取下咬嘴和水管，將它們浸泡一下。清潔完後，用清水沖洗直到將清潔劑都沖走。如果有小管子等工具，可以直接伸進內部沖洗，以確保徹底清潔。
使用清潔泡騰片。如果手洗太痲煩，可以使用清潔泡騰片。這種方法適用於水杯、水壺、水袋等各種水容器。只需添加水和一片泡騰片，等待5到30分鐘（具體時間取決於泡騰片品牌），然後泡騰片就會完成清潔工作。之後倒掉水，稍微沖洗一下即可。
儲存技巧。如果生活環境潮濕或曾用水袋裝過粘稠飲料，可以考慮在未使用時將水袋冷凍存儲。先將水袋倒空並沖洗乾淨，然後弄乾，再放入冰櫃冷凍。這樣做可以防止細菌滋生。