沉水植物是一類重要的水生生態系統組成部分，它們對維護水體健康和生態平衡具有多方面的作用。以下是沉水植物的主要功能：
促進水體氣體交換。沉水植物在水中進行光合作用，其發達的通氣組織有助於水體中的氣體交換。
淨化水質。沉水植物能夠吸收水體中的氮、磷等營養元素，抑制底泥再懸浮，促進懸浮顆粒物沉降，從而幫助淨化水質。
減緩水流。通過減緩水流，沉水植物幫助控制底泥再懸浮，有利於水體生態環境的改善。
提供食物來源和棲息地。沉水植物為魚類和其他水生動物提供食物來源和產卵棲息地，同時也為根際微生物創造微生態環境。
分泌化感物質。沉水植物能分泌化感物質，抑制浮游生物的生長，從而有助於維持水體生態平衡。
提高水體透明度。通過吸收底泥和水中的氮、磷物質，沉水植物能提高水體透明度。
生物多樣性保護。沉水植物為多種水生生物提供了棲息地，有助於維護生物多樣性。
沉水植物還對全球碳循環有著重要的影響，它們通過光合作用吸收二氧化碳，同時向水中釋放氧氣，從而有助於減緩氣候變化的影響。