電影《沙丘》講述了一箇複雜且具有深遠背景的故事，主要圍繞主人公保羅·厄崔迪和他的家族展開。
故事發生在遙遠的未來，宇宙中的帝王沙丹四世因嫉妒厄崔迪家族的權力而陰謀對付他們，將厄崔迪家族的領地轉移到卡拉丹星球，並最終導致家族被滅。保羅和他的母親傑西卡被迫逃亡至荒涼的厄拉科斯星球（也稱沙丘），並在此與當地的弗雷曼人接觸，傑西卡後來發現自己懷孕，她的內心世界與一名女巫的意識相連，從而影響了她的孩子。
與此同時，保羅發現自己具有預知未來的能力，並與沙蟲建立了溝通聯繫。他逐漸團結了弗雷曼人，並與他們一起對抗哈克南男爵和他的軍隊。故事中還涉及了香料的爭奪，這是一種珍貴的資源，對宇宙中的生活至關重要。整個故事不僅是一部關於復仇和生存的史詩，也探討了人類在極端環境下的適應和進化，以及自然與文明之間的平衡。