浮游生物在水域生態系統中扮演著多種重要角色，主要包括：
關鍵的食物鏈環節。浮遊動物作為水生生物食物鏈的重要組成部分，為許多經濟魚類提供餌料，同時也支持其他水生生物的分布和豐度。
水質改善。通過排泄和分泌作用，浮游生物在有機物質分解和循環中發揮關鍵作用。它們對污染物質的敏感性和積累能力，使它們在研究物質對生態系統的生態毒理影響方面具有重要價值。
海洋生產力的基礎。海洋浮游生物的數量多、分布廣，是海洋生態系統能量流動和物質循環的主要環節。
碳和氧氣的生產者。浮游植物通過光合作用吸收大氣中的二氧化碳，並釋放氧氣，對維持地球的二氧化碳平衡起關鍵作用。
環境變化的指示物。浮游生物對環境變化非常敏感，它們的生長狀況可以用於監測環境變化。
污水處理。一些浮游生物具有分解污染物的能力，可用於輔助污水處理。
綜上所述，浮游生物在維持水生態系統的平衡、促進生物多樣性和支持全球碳循環中發揮著不可替代的作用。