清水祖師的故事有許多，以下是其中兩個：
1. 降伏猛虎和顯現神通：傳說清水祖師有一次在樹林中走著，突然前方出現了一隻大老虎，看起來非常兇猛。清水祖師沒有害怕，反而上前與老虎對話。老虎竟然聽從了清水祖師的教誨，皈依佛法，清水祖師為其剃髮、取名。清水祖師用手杖在地上一戳，地面出現了一個大洞，他再用手一揮，洞中湧出的泉水使這裡變成了一片汪洋。
2. 建立寺廟：有一天，清水祖師來到了一個名叫“大茅山”的地方。這裡山清水秀，風景宜人，但無廟宇。於是，清水祖師決定在此地建立寺廟。他向山神祈求土地，並開始動工建造寺廟。在寺廟落成典禮的那天，許多神奇的景象出現了。
以上只是清水祖師故事的一部分，清水祖師還有許多其他的傳說和事跡。