源計畫故事主要講述了由天美工作室研發的《源計畫》網遊，這是一個以未來世界為背景的科幻題材網遊。遊戲內分為五大陣營，每個陣營都有其獨特的故事背景和角色設定。
其中，阿爾法計畫講述了未來世界面臨外星生物攻擊，人類通過基因工程創造半人半機械的超級戰士來保衛家園。歐米茄計畫則是關於政府機構在背後掌控龐大的源計畫，培養出的智慧型人類協助聯盟參與抵抗入侵。主角因為一次任務獲得了機密組織的阿爾法計畫名單，從此捲入這場激烈的對抗之中。玩家則需要帶領隊伍在各種未來科技載具的配合下，同五大陣營中的兄弟並肩作戰，守護人類的最後一片淨土。
總體來說，《源計畫》網遊以未來世界為背景，通過半人半機械的超級戰士、龐大的源計畫和外星生物攻擊等元素，講述了一個充滿科幻色彩的故事。玩家在遊戲中將扮演其中一個陣營的角色，與其他玩家一起並肩作戰，保護人類的最後一片淨土。