《燕雲台》主要講述了宰相之女蕭燕燕的一生。在劇中，蕭燕燕（唐嫣飾）是宰相蕭思溫（劉奕君飾）與燕國大長公主的第三女，作為家中最小的孩子，不僅深得父親喜歡，也深受大姐蕭胡輦（佘詩曼飾）、二姐烏骨里（盧杉飾）的寵愛，她從小養成了敢想、敢說、敢做的性格，對於追求的事物充滿執著，不輕言放棄。蕭燕燕與韓德讓（竇驍飾）兩情相悅，早定終身，在燕雲台上定情，並且在父母的支持下訂了婚約。可是因為皇帝耶律賢（經超飾）的介入，蕭燕燕不得不嫁給了耶律賢，開啟了她成為傳奇太後的一生。在耶律賢死後，蕭燕燕在兒子的支持下以太後之尊嫁給了韓德讓，最終蕭燕燕成為了愛情事業雙豐收的人生贏家。
此外，劇中蕭燕燕的侄女蕭海瀾的愛情也備受關注。蕭海瀾（龔婉怡飾）出身高貴且聰明率真、文武雙全，與年輕時的蕭燕燕如出一轍。在劇中，蕭海瀾與戰功赫赫的將軍耶律斜軫（於濟瑋）上演了一段高甜的愛戀故事，二人從少年時相愛，一直扶持到老，可以說蕭海瀾是全劇中最幸福的女人了。