狐尾藻的繁殖主要通過無性繁殖方式進行，其繁殖方法包括：
扦插繁殖。這是狐尾藻主要的繁殖方法，通常在生長季節，即四月至八月進行。繁殖時，應選擇7至9厘米長的莖尖作為插條，這樣獲得的新植物將迅速生長並迅速成型。將剪下的莖段插入基質中，深度約一半左右，保持適宜的溫度和濕度，室溫應為20至25℃，2周後可以上盆或移栽。
分株繁殖。這種方法是在四月至五月進行，將老植物用鋒利的刀切割分成若乾小株叢作為繁殖材料。
組織培養。狐尾藻的莖段可以作為培養物，通過消毒、誘導培養、分化與增殖、生根培養等步驟進行快速繁殖。一個狐尾藻莖段一年內可繁殖上萬株狐尾藻優質種苗。
狐尾藻種子具有休眠期，在乾燥條件下可保存數年，翌春休眠解除後可以進行種子繁殖。種子發芽的最佳溫度為20至25℃，可以在黑暗和長光下發芽。發芽的幼苗可以漂浮在水面上，並且可以隨水傳播。