玉兔搗藥動畫故事可以有很多版本，以下提供兩種常見版本：
版本一：
在一個神秘的月宮中，住著一隻可愛的玉兔。有一天，玉兔決定開始搗藥，為的就是能讓月宮中的神仙們能夠擁有一個健康的身體。在搗藥的過程中，玉兔遇到了一些困難，但是她並沒有放棄，一直堅持下去。最後，她搗出了一味神奇的靈藥，幫助月宮中的神仙們解決了許多難題。這個故事告訴我們，只要我們堅持不懈，努力奮鬥，就一定能夠實現自己的夢想。
版本二：
玉兔搗藥的故事與長生不老藥相關。傳說中，月亮上有一座高聳入雲的瓊樓玉宇，居住著嫦娥仙子和她的玉兔。有一天，嫦娥仙子告訴玉兔要為天下的有情人搗制長生不老藥，否則天庭將會降下災禍。於是，玉兔便開始了她漫長而繁重的搗藥工作。在這個過程中，玉兔不斷克服各種困難和挑戰，最終成功地搗制出了一爐香噴噴的長生不老藥。這個故事傳達了愛情和友情的真諦，以及善良和正義的力量。
總的來說，玉兔搗藥動畫故事可以通過各種不同的情節和角色設定來傳達各種不同的主題和價值觀。無論是堅持不懈、努力奮鬥的精神，還是愛情、友情的真諦，或是善良、正義的力量，這些主題都能引發觀眾的共鳴和思考。