生態系統，簡稱ECO，是ecosystem的縮寫。它是指在自然界的一定的空間內，生物與環境構成的統一整體。在這個統一整體中，生物與環境之間相互影響、相互制約，並在一定時期內處於相對穩定的動態平衡狀態。生態系統的範圍可以非常大，也可以非常小，它們相互交錯。例如，太陽系可以被視為一個生態系統，其中太陽提供能量，類似於一台發動機。
地球上最大的生態系統是生物圈，而最複雜的生態系統是熱帶雨林生態系統。人類主要生活在以城市和農田為主的人工生態系統中。生態系統是開放系統，為了維繫自身的穩定，需要不斷輸入能量，否則就有崩潰的危險。許多基礎物質在生態系統中不斷循環，其中碳循環與全球溫室效應密切相關。生態系統是生態學領域的一個主要結構和功能單位，屬於生態學研究的最高層次。