生物燃料包括多種類型，主要可以分爲以下幾類：
燃料乙醇。這是一種無水乙醇燃料，可作爲汽油添加劑，提高辛烷值，減少礦物燃料燃燒產生的大氣污染。它可以通過農作物發酵生產，其燃燒排放的二氧化碳與作物生長過程中消耗的二氧化碳基本持平，有助於減少總的二氧化碳排放。
生物柴油。這是一類清潔的可再生能源，由油料作物、油棕、黃連木等油料、林木果實、工程微藻、水生植物以及動物油脂、廢餐飲油等製成。生物柴油是優質的石化柴油替代品，具有優良的環保性，較好的低溫發動機啓動性能和安全性。
生物質燃料。這主要包括農林廢棄物如秸稈、鋸末、甘蔗渣、稻糠等，這些材料可以作爲固體生物燃料燃燒使用。
除此之外，還有生物丁醇、生物沼氣等。這些生物燃料均可再生，且相較於傳統石油或煤炭燃料，它們的使用有助於減少環境污染和溫室氣體排放。