番茄的整枝方法因品種和生長環境而異，主要分為以下幾種：
無限生長或蔓生番茄。在全日照、水肥充足的環境下，可採用單桿整枝，即保留主幹，摘除所有側枝。或者雙桿整枝，即保留第一串花序右側長出的側枝，其他側枝全部摘除。
矮生或侏儒型番茄。需要摘花以促進分枝，以達到更好的爆盆效果。
叢生或垂吊型番茄。在全日照、水肥充足的環境下，不需要摘除側枝。
自封頂番茄。通常在長到一定高度後會停止生長，可以根據日照環境適當多留側枝以增加產量。
此外，進行整枝時，應注意以下幾點：
側枝和腋芽應從根部摘除，以避免擴大傷口。
摘除側枝和腋芽的最佳時間是晴天午後，這有助於傷口癒合。應避免在陰雨天或清晨、傍晚進行整枝，以減少病害風險。
可以使用手指甲或剪刀進行整枝。剪下的枝條可以扦插繁殖更多的番茄苗。