神奇寶貝金手指的使用方法因使用的遊戲模擬器而異，以下是在不同模擬器中使用金手指的步驟：
Visual Boy Advance（VBA）模擬器。打開模擬器並運行遊戲；點擊“修改”並選擇“金手指列表”；在金手指列表中輸入金手指代碼，然後點擊“確定”；當金手指列表中的“status”項顯示爲“E”時，表示金手指正在使用；若要關閉金手指，去掉代碼前的勾選框，“status”狀態變爲“D”，表示金手指已關閉。
NO$GBA模擬器。打開模擬器並運行遊戲；按F2鍵彈出窗口；點擊“Add New”輸入金手指代碼；輸入金手指的簡述，選擇相關選項；點擊“OK”保存金手指；在金手指列表中雙擊激活或禁用金手指；若要刪除金手指，選擇要刪除的金手指，然後點擊第三個按鈕（delete），然後關閉並重新打開模擬器。
這些步驟提供了在不同模擬器上使用金手指的基本流程，但請注意，具體的使用方法可能會根據不同的遊戲版本和模擬器版本有所差異。