《神奇寶貝》Red的故事是該系列遊戲及動漫作品的早期故事之一，主角小智在遊戲中和動畫中的初識夥伴兼勁敵。遊戲故事講述了出身在神奇寶貝專家家庭的少年小智，立志要成為神奇寶貝的超能力訓練師。
在旅途中，小智邂逅了橙華道場的少女小霞，並加入了對戰聯盟的行列，為了成為真正的神奇寶貝大師而不斷奮鬥。然而，在故事的早期階段，小智經常與自己的皮卡丘戰鬥，因為皮卡丘與其他神奇寶貝不同，傾向於自己選擇主人。 即使到了遊戲後期，小智也會在比賽結束時因為犯規而被驅逐，導致故事的許多發展都是在對抗各種意外事件的情況下進行的。
然而，與故事版本的動畫和漫畫不同，原版的故事並未突出某個特定角色的主角地位，也沒有明確定義的主角是小智、小霞還是小茂。這個早期故事展現了少年們的冒險歷程和各種對戰經驗，也提供了對當時許多熱鬥神奇寶貝的初步介紹。儘管在故事的某些方面可能顯得單調和重複，但Red的故事仍然提供了對早期神奇寶貝世界觀的初步了解。