空中瑜伽的缺點主要包括：
需要專業指導。空中瑜伽需要在專業人員的指導下進行，以確保正確的姿勢和技巧，避免受傷。
身體限制。由於空中瑜伽需要一定的力量和靈活性，對於初學者或身體較弱的人來說可能有一定難度。
依賴懸掛裝置。空中瑜伽需要使用特殊的懸掛裝置，這可能不方便在家中進行練習，並增加了練習過程中的安全隱患。
可能影響身體健康。長期做空中瑜伽可能還會影響到頭部的正常血液循環，導致大腦缺氧，伴隨頭暈、頭痛、頭部暈厥等症狀。
存在安全風險。空中瑜伽的練習中存在掉下來的危險，如果沒有專業人士的代練，可能會引發噁心頭暈等症狀。
教練資質問題。空中瑜伽教練資質混亂，安全缺乏保障，衛生狀況堪憂。
練習不當可能受傷。不懂呼吸或無節奏的呼吸，過度強迫自己，忽視肌肉耐力，常識性的錯誤認知等都可能導致身體不適。
存在一定危險係數。空中瑜伽比較危險，容易受傷，不適合新手學習。