糖原染色常用的方法有過碘酸—Schiff氏法（簡稱P.A.S）和過碘酸雪夫液法。兩種方法的操作步驟如下：
過碘酸—Schiff氏法。石蠟切片脫蠟至水；0.5%過碘酸水溶液或1%過碘酸95%酒精溶液氧化5分鐘；蒸餾水洗，70%酒精洗；Schiff氏液侵染10~30分鐘（從冰櫃取出升至室溫使用）；流水沖洗10分鐘；蘇木素浸染細胞核2~3分鐘；脫水、透明、封蓋。糖原呈紅色，細胞核呈藍色。
過碘酸雪夫液法。乾燥塗片或切片，滴加甲醛固定液固定10分鐘，流水沖洗；滴加過碘酸溶液作用20分鐘，流水沖洗；滴加雪夫液作用60分鐘，流水沖洗；滴加甲基綠溶液復染10分鐘，流水沖洗後鏡檢。
這兩種方法都旨在顯示細胞內的糖原，其原理在於過碘酸將糖原氧化，生成醛基，然後與染色液中的特定試劑結合，形成可檢測的化合物。