職業藥師和執業藥師的區別如下：
所屬系統不同。執業藥師考試是由國家人事部和食品藥品監督管理局組織的，屬於藥監繫統；而藥師考試是國家衛計委組織的，屬於衛生系統。
報名時間不同。執業藥師的報名一般在7月至8月；而藥師的報名一般在12月。
報考要求不同。以本科爲例，畢業從事相關工作三年纔可以考執業藥師；但是畢業一年就可以考初級藥師。
使用方向不同。執業藥師考取證書之後一般是在藥店工作，國家規定每個藥店必須配備一箇執業藥師；初級藥師是技術職稱，需要由單位進行聘任。
是否需要註冊。執業藥師需要註冊才能執業，每年還有一定課時的繼續教育課程；藥師證不需要註冊，只要根據用人單位的要求提供需要的證件即可。