使用育苗盒的方法主要包括以下幾個步驟：
準備育苗盒。市面上有多種類型的育苗盒，如塑膠育苗盒、紙質育苗盒等，選擇時應考慮植物的大小和所需生長空間。常見的育苗盒組件包括蓋子、穴盤和底托。
準備營養土。營養土是植物生長的基礎，應具有透氣性、水分保持性和排水性。可以自行配製或購買市售的營養土。
播種。在穴盤中均勻鋪上一層營養土，留出足夠的空間供植物生長。將種子撒在營養土上，輕輕覆蓋一層薄薄的營養土。對於一些較小的種子，可以使用蛭石等材料代替土壤覆蓋。
澆水。澆透水以保持營養土濕潤，但注意不要積水。可以將底托填入水，再將穴盤放入水中，以更好地控制水分。
覆蓋和保溫。使用蓋子來保溫保濕，特別是在早春和深秋季節。晚上蓋上蓋子可以保暖，白天應掀開蓋子以防過熱。
放置位置。將育苗盒放置在光線充足、通風良好的地方，以促進植物生長。
養護和管理。定期檢查水分和光照，保持適宜的生長環境。注意防治害蟲和病害。
移植。當幼苗長到一定大小時，應將其移植到更大的容器或田間，以繼續生長。