胺基酸液相分析方法主要包括以下幾種：
離子交換色譜法（IEC）。這種方法基於陽離子交換柱分離，使用柱後茚三酮衍生和光度法測定。它是由Stein和Moore在1958年發明，並於1972年獲得諾貝爾獎，是國際和國家標準以及仲裁和涉外方法。
高效液相色譜法（HPLC）。HPLC是一種更常用的方法，它基於反相色譜分離，通常採用柱前衍生化，然後利用螢光或紫外檢測。HPLC系統包括溶劑泵、進樣器、色譜柱、檢測器和數據處理系統，可以通過最佳化流速、柱溫、檢測波長等參數來實現胺基酸的高效分離和定量測定。
離子色譜法（IC）。這種方法適用於陰離子交換分離，通常採用安培檢測法進行直接檢測。雖然通常將陰離子交換和陽離子交換都稱為IEC，但在此將陰離子交換分離、安培檢測的方法歸類為IC，因為這類儀器實際上是離子色譜儀，配置側重點為胺基酸分析。
這些方法各有特點，適用於不同的套用和分析需求。例如，HPLC具有高解析度、高靈敏度和高效率等優勢，被廣泛套用於生物製藥領域，可以用於分析不同來源的胺基酸，評估蛋白質質量和純度，監測胺基酸代謝變化以及研究蛋白質組成和結構等。