能量杯的使用方法主要包括以下幾個方面：
初次使用前，需要先用開水清洗能量杯，搖晃若乾次後倒出，重複此過程幾次，直到倒出的水清澈為止。
每天早晨起床後空腹飲用1~2杯水，有助於調節體液濃度和及時排除夜間代謝產物，促進腎臟和肝臟的解毒功能。
在工作和活動期間，每隔2~3小時飲用1~2杯水，以補充流失的水分和微量元素，調節體液平衡。
進餐半小時後飲用1杯水，以增強腸胃的消化功能。
睡前半小時飲用1杯水，以儲存睡眠期間所需的水分。
使用能量杯時，建議選擇優質礦泉水或經過水處理設備處理過的水。能量杯的杯芯可以處理2000~3000升水，使用壽命可達3~5年，具體取決於水質和使用頻率。
長期不使用時，應使用清水將能量杯清洗乾淨，並晾乾存放。
根據需要，可以定期使用檸檬酸或白醋對能量杯進行清洗，以保持其性能。
此外，能量杯還可以用於製作特定飲品，如將開水倒入杯中預熱內膽，然後加入特定食材（如米糝），再倒入95°C以上的開水，擰緊杯蓋進行燜燒，等待約150分鐘後即可享用。