使用臭氧的主要方法是利用臭氧發生器產生臭氧進行消毒和淨化。
使用臭氧發生器時，應將其放置在待消毒室的室外或特定位置，並確保臭氧矽膠軟管與機器的臭氧輸出口接好，將臭氧輸送管導入待消毒空間。使用時接通電源，打開氣泵開關，氣泵開始工作，臭氧輸出口有氣體輸出，根據空氣溫度和濕度設定適當的工作時間，一般1到30秒。完成消毒後，臭氧發生器將自動停止工作或可以手動關閉，並應將電源插頭拔出。
消毒完成後，臭氧發生器應移至乾燥通風處，以避免因高溫環境產生積水，影響設備性能。在使用過程中，應保持室內空氣流通，可以通過打開窗戶或使用風扇來實現。另外，在使用臭氧機時，建議穿戴適當的防護手套和護目鏡，避免直接接觸臭氧。