《與朱元思書》的重點內容主要包括以下幾個方面：
通假字和古今異義。例如，「轉」通「囀」，指蟬鳴；「反」通「返」，意為返回。古今異義如「東西」古義指向東向西，今義指物品；「許」古義表示約數，今義有多種含義如或許、應允等。
一詞多義。如「絕」既可以形容詞表示「絕妙」，也可以動詞表示「窮盡、斷絕」。
描繪山水之美。文章通過對奇山異水的描繪，表現了自然景物的獨特美，如「奇山異水，天下獨絕」。
表達作者的情感和志趣。文章通過描繪自然景物，表達了作者對世俗煩擾的超脫和對自然的熱愛，同時也反映了作者的隱逸思想。