花甲的保存方法取決於其新鮮度以及打算保存的時間長度，以下是一些常用的花甲保存方法：
快速冷藏法。將花甲裝入保鮮袋或塑膠密封盒中，確保儘量減少空氣接觸，然後放入冰櫃冷藏室，儘量在24小時內食用。
蒸煮保鮮法。將花甲高溫蒸煮5~8分鐘，徹底加熱後取出，晾涼後包裹好，放入冰櫃冷藏室。
鹽水浸泡法。將花甲放入鹽水中浸泡，每500克花甲加入適量的鹽和清水，浸泡時間不宜超過12小時，浸泡後將花甲瀝乾，放入冰櫃冷藏室。
煮熟分裝法。將花甲煮熟後分成小份，放入密封袋或容器中，放入冰櫃冷凍室。
做菜冷藏法。如果打算第二天用花甲做其他菜品，可以將剩餘的花甲和其它食材一起做成菜品，放入冰櫃冷藏室。
室溫保存法。對於新鮮的花甲，可以用海鹽配置海水，將其平鋪在大的烤盤之類的容器中，注入沒過花甲殼的清水，放在低於10℃的地方保存。
冷凍保存法。對於剛死亡的花甲可以快速清洗，瀝乾水分，直接放入冷藏室或冷凍室保存。
選擇合適的保存方法取決於你對花甲的保存時間和其當前狀態的需求。