花骨魚可以通過多種方法進行烹飪，如紅燒、煎炸或燉煮。以下是幾種常見的烹飪方法：
紅燒花骨魚。先處理並清洗花骨魚，兩面切細刀以便更好地吸收調味料的味道，用鹽醃製去腥，再沾上一層薄薄的麵粉，熱鍋中加油，將魚煎至兩面金黃，煎好的魚放入鍋中，加入肉片、姜、蔥、郫縣豆瓣醬、黃豆醬等調料，小火炒出醬香，加入適量清水、料酒和紅燒汁，大火煮開後轉中火燉煮十分鐘，最後加入香菜和辣椒，大火收汁即可。
煎炸花骨魚。將處理好的花骨魚沾麵粉後煎至兩面金黃，再根據個人口味加入不同的調料。
燉煮花骨魚。將處理好的花骨魚加入姜、蔥、蒜等調料煸炒出香味，加入適量清水和其他調味料如料酒、生抽、老抽等，大火煮開後轉中火燉煮至入味。
每種烹飪方法都有其獨特的風味，可以根據個人喜好和食材的新鮮程度選擇合適的做法。