芽管，也稱為germ tube，是指在發芽時伸展出的無隔壁的管狀構造。在孢子壁的一定部位有小孔，芽管從這裡伸出，此時將小孔稱為芽孔(germ pore)。芽管的生殖方式為無性生殖，孢子類型包括孢囊孢子、分生孢子。