蘿蔔糠心的原因有多種，主要包括以下幾點：
水分缺失。特別是在蘿蔔膨大期，如果水分供應不足，蘿蔔的根莖會出現缺水現象，導致細胞收縮和間隙擴大，從而引起糠心。
施肥不當。如氮肥施用過量，會促使蘿蔔地上部分生長過旺，消耗大量養分，從而影響地下部分肉質根的養分供應，造成糠心。
土壤類型。沙質土壤或沙性大的土壤保水保肥能力較差，不利於蘿蔔根莖的生長，容易引發糠心。
種植密度不合理。如果蘿蔔種植過於稀疏或過於密集，都會影響蘿蔔地上部分和地下部分的平衡生長，可能導致糠心。
溫度和光照條件。高溫天氣，尤其是蘿蔔膨大期遇到的高溫，會加劇蘿蔔的呼吸作用和蒸騰作用，導致水分消耗過大，容易引起糠心。
品種特性。肉質根薄壁細胞大的品種更易出現糠心。
先期抽薹。蘿蔔抽薹後，營養元素向地上部分轉移，根莖營養供應不足，導致糠心。
儲藏不當。蘿蔔收穫後，如果儲藏溫度過高或空氣溼度過低，會導致蘿蔔失去大量水分而糠心。